25августа2009 г. открыт факультет инновационных технологий. Новый факультет вырос из упраздненного в 2008 г. Томского инновационного центра Западной Сибири, который работал с 1993 г. на базе Томского государственного университета. Обучение на факультете проходит по трем специальностям: «Прикладная информатика в экономике», «Управление качеством» и «Управление инновациями».
