Ольга Викторовна Карначук
Дата рождения:

12 марта 1962 г.

Место рождения:

Томск

Альма-матер:

Томский государственный университет


КАРНАЧУК Ольга Викторовна (р. 12 марта 1962, Томск) – профессор кафедры физиологии растений и микробиологии.

Биография

Отец К., Виктор Иванович (р. 1937), окончил физ.-техн. ТПИ, канд. техн. наук, доц. каф. электроники и автоматики физ. установок (№ 24) ТПУ. Мать К., Раиса Александровна (дев. Рябкова, 1937-2012), д-р биол. наук, проф. каф. физиологии растений и микробиологии, засл. проф. ТГУ.

После окончания средней школы № 18 в Томске (1979) К. поступила на биол.-почв. ф-т ТГУ. Среди ее учителей А.В. Положий, В.И. Гриднева, Р.А. Карначук, Л.И. Потехина и др. Принимала участие в науч.-исслед. работе и выступала с докл. на науч.-студ. конф. Окончила с отличием ун-т (1984) по специальности «биология» с квалификацией «преп. биологии и химии средней школы», защитив дипломную работу «Микробиол. характеристика меромиктических озер Марийской АССР» (науч. руководители канд. биол. наук М.Б. Вайнштейн и Б.Б. Намсараев), выполненную в Ин-те биохимии и физиологии микроорганизмов АН СССР, Пущино. После окончания ун-та обучалась в аспирантуре ТГУ и Ин-та микробиологии АН СССР (Москва). С 1995 – доц., с 2007 – проф., с 2012 – зав. каф. физиологии растений и биотехнологии Биол. ин-та ТГУ. Одновременно зав. лаб. биотехнологии и биоинженерии ТГУ. Учен. звание ст. науч. сотр. по специальности микробиология присвоено ВАК в 1995, проф. по каф. физиологии растений и биотехнологии Минобрнауки РФ в 2010. Читает курсы: «Микробиология», «Биотехнология», «Введение в биотехнологию», «Совр. молекулярные методы в биологии», «Экология микроорганизмов», «Загрязнение водных экосистем», «Экол. политика и институты»

Обл. науч. интересов К. – микробиология, молекулярная биология, биотехнология микроорганизмов и биоинформатика. В период работы над канд. дис. К. изучала распространение сульфатредуцирующих бактерий и измерила интенсивность бактериальной сульфатредукции в прибрежных морских осадках. Показана ведущая роль сульфатредукции в анаэробной деструкции органического вещества в прибрежных морских осадках по сравнению с микробным метанобразованием и целлюлозоразложением. Впервые исследовано распространение сульфатредуцирующих бактерий и измерена интенсивность бактериальной сульфатредукции в прибрежных илах Яп. моря, мелководных осадках сев.-зап. шельфа Черного моря, осадках и манграх залива Батабано (Карибское море) и осадках и альго-бактериальных матах бухты Кратерной (Курильские острова, Охотское море). В 1989 в дис. совете при Ин-те микробиологии АН СССР защитила дис. «Бактериальная сульфатредукция в прибрежных морских осадках» на соиск. учен. ст. канд. биол. наук (специальность 03.00.07 – микробиология; науч. руководитель, акад. АН СССР М.В. Иванов; офиц. оппоненты д-р биол. наук С.С. Беляев; канд. геол.-минерал. наук В.А. Игумнов; утв. ВАК в 1987).

В последующий период К., проводя исследования в области геол. активности сульфатредуцирующих бактерий (СРБ), сосредоточила внимание на изучении реакций цикла серы и металлов, осуществляемых СРБ и связанных с образованием и растворением материалов. Изучила распространение и активность СРБ в экосистемах, связанных с добычей и переработкой сульфидных минералов. Определила состав микробного сообщества, диссимиляторно восстанавливающего сульфаты, включая культивируемые и некультивируемые формы в экосистемах, связанных с добычей и переработкой сульфидных минералов. Выделила СРБ, устойчивые к катионам металлов, изучила их физиологию, возможные механизмы устойчивости к металлам и реакции осаждения металлов. Исследовала реакции использования нерастворимых сульфатов и сульфитов в качестве акцептора электронов чистыми культурами и природными популяциями СРБ и определила возможность образования минералов в качестве конечных продуктов этих реакций.

Выявленные К. закономерности образования сульфидов в экосистемах, связанных с добычей и переработкой металлов, важны для создания технологий по очистке этих экосистем, таких как искусственные ветланды, активные зоны сульфатредукции и реакционные барьеры. Определенные скорости пиритообразования в коре выветривания рудных месторождений могут быть использованы при оценке естеств. процессов аттенюации металлов. Занимаясь поиском сульфатвосстанавливающих бактерий, устойчивых к меди, в природных местообитаниях, обратила внимание на места добычи сульфидных руд, содержащих повышенные концентрации металлов (Норильская пром. зона и Кольский полуостров). В результате комплексных исследований микроорганизмов, восстанавливающих сульфаты в различных экосистемах Норильска и Кольского полуострова, была получена представительная коллекция бактерий, устойчивых к меди. Уникальная коллекция штаммов послужила основой для изучения механизмов устойчивости к меди у анаэробных сульфатвосстанавливающих бактерий, а также впервые дала возможность изучить хим. и минерал. состав биогенных сульфидов металлов, образуемых микроорганизмами.

В ходе изучения биохим. и молекулярных механизмов устойчивости к меди в совершенно неизученной с этой точки зрения группе микроорганизмов при поиске генов, родственных известным системам в аэробных бактериях, была (совм. с учеными ун-та Берна) определена последовательность полных геномов двух организмов из коллекции, что позволило отыскать и проследить эволюцию систем гомеостаза меди у анаэробных сульфатвосстанавливающих бактерий. В 2006 в дис. совете при Ин-те микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН защитила дис. «Образование и растворение серосодержащих минералов сульфатредицирующими бактериями» на соиск. учен. ст. д-ра биол. наук (специальность 03.00.07 – микробиология; науч. консультант акад. РАН М.В. Иванов; офиц. оппоненты д-ра биол. наук, проф. В.М. Горленко, И.Н. Гоготов и А.С. Яненко; утв. ВАК в 2007).

К. принимала участие в работе многих междунар. и всерос. конф. В их числе: IX Междунар. симпоз. по биогеохимии окружающей среды (Москва, 1989); Inter. Conf. on Arctic Microbiology (Rovaniemi, Финляндия, 2004); 1st Inter. Conf. on Environmental, Industrial, and Applied Microbiology (Badajoz, Испания, 2005); 11th Inter. Symposium on Microbial Ecology (Вена, Австрия, 2006); II Inter. Conf. on Environmental, Industrial, and Applied Microbiology (Севилья, Испания, 2007); 6th Inter. Copper Meeting. Copper and related metals in biology (Алгеро, Сардиния, Италия, 2008); BioMicroWorld 2009. III Inter. Conf. on Environmental, Industrial and Applied Microbiology (Португалия, Лиссабон, 2009); 8th Inter. Congress on Extremophiles (Понта-Делгада, Азоры, Португалия, 2010); 7th Inter. Copper Meeting: Copper in Biology (Алгеро, Сардиния, Италия, 2010); Geological and medical science for a safer environment. Book of abstracts. IV Inter. conf. on medical geology GEOMED 2011 (Бари, Италия, 2011); Междунар. конф. «Экология и геохим. деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний» (Улан-Удэ – Улан-Батор, 2011); 8th Inter. Сopper Meeting: Copper in Biology (Алгеро, Сардиния, Италия, 2012).

Авт. около 110 работ, в т. ч. 2 учебников и учеб. пособий. Имеет 3 патента на изобретения. Подготовила 5 канд. наук (С.Ю. Курочкина, Ю.А. Франк, И.В. Лущаева, А.Л. Герасимчук и О.П. Иккерт). Исследования К. финансировались ЕС, проводились совм. с исследователями из Финляндии, Швеции и США: каф. микробиологии Ун-та штата Огайо (Колумбус, США); Технол. ун-т Тампере (Финляндия); каф. экологии микроорганизмов ун-та Вены (Австрия); каф. клин. фармакологии Ун-та Берна (Швейцария). Выполнение проекта, посвящ. изучению микроорганизмов, связанных с местами добычи металлов, позволило освоить и применить на практике совр. методы молекулярной экологии микроорганизмов. К. – чл. ред. совета междунар. ж. «Dataset Papers in Microbiology» (с 2011). Рецензент науч. работ для высокорейтинговых рос. и междунар. ж. в обл. микробиологии, биотехнологии и экологии, таких как «Микробиология», «FEMS Microbiology Ecology», «Letters in Applied Microbiology» (Blackwell Publishing), «Journal of Hazardous Materials» (Elsevier). Руководитель проекта по организации молодежной Всерос. школы-семинара «Совр. фундаментальные проблемы физиологии и биотехнологии растений и микроорганизмов» (Томск, ТГУ, 2008). Приглашенный проф. Ун-та штата Огайо (Колумбус, США) и Технол. ун-та (Тампере, Финляндия).

Стажировалась в Технол. ун-те (Тампере, Финляндия). К. – председатель Том. отд-ния Межрегион. обществ. организации «Микробиол. об-во» (с 2006). Руководитель направления по технол. платформе «Биотехнология» в ТГУ (2011). Награждена золотой медалью II Биотехнол. выставки-ярмарки «РосБиоТех-2008» и памятной медалью В.Н. Новосильцева Междунар. фонда биотехнологий им. акад. И.Н. Блохиной за разработку технологии осаждения ионов тяжелых металлов под действием сульфатредуцирующих бактерий (2008). Лауреат конкурса Том. обл. в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры (2007). Награждена медалью «За заслуги перед Том. гос. ун-том» (2008).

Труды

  • Совм. с S.Y. Kurochkina, O.H. Tuovinen. Growth of sulfate-reducing bacteria with solid-phase electron acceptors // Applied Microbiol. Biotechnol. 2002. Vol. 58;
  • Совм. с S.Y. Kurochkina, D. Nicomrat еt al. Copper resistance in Desulfovibrio strain R2 // Antonie van Leeuwenhoek. 2003. Vol. 83;
  • Совм. с D. Banks, V.P. Parnachev, B. Frengstad et al. The evolution of alkaline, saline ground- and surface waters in the southern Siberian steppes // Applied Geochem. 2004. Vol. 19;
  • Совм. с N.V. Pimenov, S.K. Yusupov et al. Sulfate reduction potential in sediments in the Norilsk Mining area, Northern Siberia // Geomicrobiol. J. 2005. Vol. 22;
  • Совм. с J.P. Gramp , K. Sasaki et al. Formation of covellite (CuS) under biological sulfate-reducing conditions // Geomicrobiol. J. 2006. Vol. 23 (8);
  • Совм. с D. Kupka, O.I. Rzhepishevska et al. Bacterial oxidation of ferrous sulfate at low temperatures // Biotechnol Bioeng. 2007. Vol. 97(6);
  • Совм. с K. Sasaki, A.L. Gerasimchuk, et al. Precipitation of Cu-sulfides by copper-tolerant Desulfovibrio isolates // Geomicrobiology J. 2008. Vol. 25;
  • Совм. с А.Л. Герасимчук, Д. Бэнкс, Б. Френгстадт и др. Бактерии цикла серы в осадках хвостохранилища добычи золота в Кузбассе // Микробиология. 2009. Т. 78, № 4;
  • Совм. с А.Л. Герасимчук, А.А. Шаталовым, А.Д. Новиковым и др. Поиск сульфатредуцирующих бактерий в пробах мата из гидротермального поля Лост Сити методом молекулярного клонирования // Микробиология. 2010. Т. 79, № 1;
  • Совм. c H.K. Abicht, S. Mancini and M. Solioz. Genome Sequence of Desulfosporosinus sp. OT, an Acidophilic Sulfate-Reducing Bacterium from Copper Mining Waste in Norilsk, Northern Siberia // J. Bacteriol. 2011. Vol. 193, № 21;
  • Их же. Genome Sequence of Desulfovibrio sp. A2, a Highly Copper Resistant, Sulfate-Reducing Bacterium Isolated from Effluents of a Zinc Smelter at the Urals // Там же. № 23.

Источники и литература